2024年度 大阪大学蛋白質研究所「単粒子解析ワークショップ」 開催のご案内

2024年08月02日 会合

近年のクライオ電子顕微鏡を用いた単粒子解析の進展はめざましく、タンパク質構造解析の主流になりつつあります。本ワークショップではクライオ電子顕微鏡の初心者を対象に、単粒子解析の原理、画像処理、三次元再構成、原子モデリングについての計算機実習を行います。参加形態は、オンサイトにて実際にPCを使った実習と講義の受講をするオンサイトコースと、オンラインにてオンサイトコースの参加者の作業を見学するオンラインコースの２種類から選択することができます。今回は画像解析プログラムとしてcryoSPARCを、モデリングとしてAlphahold、DeepMainmast、及びISOLDEを用いて行う予定です。

日時
2024年9月5日（木）10時〜17時、　9月6日（金） 10時〜15時30分

スケジュール
【2024年9月5日（木）】
・10:00〜12:00 cryoSPARCの使い方及び画像解析の原理（Motion correctionから2D classification）
・13:30〜17:00 cryoSPARCの使い方及び画像解析の原理（Initial model buildから3D reconstruction）
【2023年9月6日（金）】
・10:00〜11:00 ChimeraXの使い方
・11:10〜12:00 Alphafoldによる構造予測とDeepMainmastによるde novo modeling
・13:30〜15:30 ChimeraX/ISOLDEによるモデリング

定員
オンサイトコース　4人　（会場：蛋白質研究所 本館２階　中会議室）
オンラインコース　１００人程度

参加費
無　料

申込方法
以下のgoogle formより申請してください。オンサイトコース希望の方は締め切り後に抽選後に結果をメールにて連絡いたします。
オンライコース希望の方は締め切り後にzoomのリンクをメールにてお送りいたします。
https://forms.gle/DK3W99sq7AbJzkn97

申込締切
2024年8月26日(月）
※締切前に定員に達した場合、受付を締め切る場合があります。

ソフトウェアの事前インストールのお願い
UCSF ChimeraX

※UCSFChimeraXは非商用(non-commercial)目的の場合のみ無料で使えるソフトです。商用目的の場合は有料となります。企業の方でUCSF ChimeraXのインストールが難しい場合は、申し訳ありませんが見学だけとさせていただきます。

講義・講習の担当
加藤　貴之（大阪大学・蛋白質研究所）、岸川　淳一（京都工芸繊維大学）、木原　大亮（Purdue University）

お問合せ
tkato[at]protein.osaka-u.ac.jp（[at]を@に変更してください。）

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