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2014年01月16日 掲載 (Published 01/16/2014)


「BIOPHYSICS」にYoichi Yamazaki et al. “Mapping of the local environmental changes in proteins by cysteine scanning”を掲載

日本生物物理学会欧文誌[BIOPHYSICS]に以下の論文が新規掲載されました。

Yoichi Yamazaki, Tomoko Nagata, Akihisa Terakita, Hideki Kandori, Yoshinori Shichida, Yasushi Imamoto
“Mapping of the local environmental changes in proteins by cysteine scanning”

【Editor's Summary】
システインスキャンによる蛋白質内の局所的環境変化のマッピング

蛋白質の構造変化は、鍵となるアミノ酸残基周辺の環境変化によって引き起こされる。このような分子内の環境変化をマッピングするため、システイン残基を系統的に導入し、そのSH伸縮振動の変化を赤外分光法で検出する「システインスキャン」を開発した。その有効性をロドプシンの初期中間体であるバソロドプシンで検証したところ、結晶構造解析で示された微小な構造変化を感度良く検出できることがわかった。

Mapping of the local environmental changes in proteins by cysteine scanning

The detection of the local environmental changes around the key amino acid residues is essential to understand the activation mechanisms of functional proteins. Here we developed the methods to scan the local environmental changes using the vibrational band of cysteine S-H group. We validated the sensitivity of this method using bathorhodopsin, a photoproduct of rhodopsin trapped at liquid nitrogen temperature. While most of cysteine residues demonstrated no shift of S-H stretching mode, cysteine residues introduced in the vicinity of the chromophore demonstrated the significant changes. The current results are consistent with the crystal structure of bathorhodopsin.

BIOPHYSICS, Vol.10, pp.1-7

URL:http://dx.doi.org/10.2142/biophysics.10.1