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2014年03月03日 掲載 (Published 03/03/2014)


「BIOPHYSICS」にHidenao Arai et al. “Optimal terminal sequences for continuous or serial isothermal amplification of dsRNA with norovirus RNA replicase”を掲載

日本生物物理学会欧文誌[BIOPHYSICS]に以下の論文が新規掲載されました。

Hidenao Arai, Koichi Nishigaki, Naoto Nemoto, Miho Suzuki and Yuzuru Husimi
“Optimal terminal sequences for continuous or serial isothermal amplification of dsRNA with norovirus RNA replicase”

【Editor's Summary】
進化実験用dsRNA複製酵素の提案とその新奇な振る舞い

タンパク質の試験管内自律進化に向け、著者らはdsRNA複製可能なノロウイルスRNA複製酵素を候補に挙げている。本酵素の試験管内進化実験への応用可能性を示し、RNA複製反応における鋳型RNAの最適末端配列を継代植え継ぎ実験より同定した。本酵素はssRNAから出発する回分反応か連続反応かで最適末端配列が異なる。このことから、鋳型転位によるシャトル方式と言える新しい増幅様式が示唆された。


A candidate of dsRNA replicase for in vitro evolution and its odd behaviors.

Authors are proposing to apply norovirus RNA replicase to in vitro autonomous evolution of a protein. To show the availability of this replicase for in vitro evolution, they performed a serial transfer using this replicase and RNA library randomized at the 3’-terminus, and identified the optimal terminal sequences of RNA template. The optimal sequences were different whether for batch amplification starting from ssRNA or for serial transfer. Based on this finding, it was suggested that this replicase has a novel RNA replication scheme, which can be called “shuttle mode”, using templates translocation.


BIOPHYSICS, Vol.10, pp.15-23

URL:http://dx.doi.org/10.2142/biophysics.10.15