2014年06月30日 会合
主催:
HPCI戦略プログラム 戦略分野1「予測する生命科学・医療および創薬基盤」
共催:
産業技術総合研究所 ゲノム情報研究センター(CBRC)
理化学研究所情報基盤センター
特定非営利活動法人バイオグリッドセンター関西
後援:
バイオスーパーコンピューティング研究会
日時:2014年7月24日(木)13:00 ~ 17:00(12:30 より受付開始)
場所:産業技術総合研究所・臨海副都心センター 別館8階 コラボレーションコーナー
アクセス http://www.cbrc.jp/ja/map.ja.html
概要:
3月に開催し好評をいただいた講演会「だれにでもわかる拡張サンプリングシミュレー
ション - 長時間分子動力学シミュレーションへの挑戦 -」の実習編を開催いたします。
ここでは、拡張サンプリングシミュレーションを実装したソフトウェアmu2lib
(http://www.mu2lib.org/) を用いて、粗視化モデルと連成させることで効率的に
構造サンプリングを行うMultiscale Enhanced Sampling(MSES)法と、構造変化の
自由エネルギー最小経路を求めるString法の実習を行います。この実習を通じて、拡
張サンプリングシミュレーションに対する具体的なイメージをつかんでいただければ
幸いです。
参加費:無料
定員:10名
申込受付開始:2014年7月1日(火)11時より
先着順でお申し込みを受け付けますので、定員になり次第終了します。
参加申し込み:
次のホームページからお申し込みください。
https://hpci.cbrc.jp/modules/tutorial/F-1.html
申込ボタンは、受講申込受付期間中のみ、表示されます。
受講者には事務局から事前準備についてお知らせしますので、指示に従ってご準備を
お願いいたします。
(注)実習は、受講者が各自持参するノートPC から京互換機にリモートログインして
行いますので、受講者には事前にSSH鍵ペアのご準備をお願いいたします。またSCLS
利用アカウントの申請手続きも別途必要です。(実習用PCは無線LAN必須、最新の
ウイルスチェッカーがインストールされているものをご持参ください。)
SCLS利用アカウント申請にあたっては、下記URLにあるSCLS公募の「応募資格」を
満たしていることが条件となります。満たさない方は受講できません。
http://www.scls.riken.jp/supercomputer/public.html
問合先:
独立行政法人理化学研究所・HPCI 計算生命科学推進プログラム
Email: scls-mado(at)riken.jp
迷惑メール対策のため、メールアドレスの(at)を@に置き換えてください。 (Please use at sign instead of (at).)